O organograma representa a estrutura da Secretaria-Geral do Ministério da Defesa Nacional (SGMDN), liderada por um Secretário-Geral coadjuvado por um Secretário-Geral Adjunto.
Diretamente abaixo do Secretário-Geral, estão:
A Direção de Serviços de Planeamento e Coordenação (DSPC);
A Direção de Serviços de Assuntos Jurídicos e Contencioso (DSAJ);
A Direção de Serviços de Gestão de Recursos Humanos (DSGRH), que tem na sua dependência a Divisão de Recursos Humanos (RH);
A Direção de Serviços Administrativos e Financeiros (DSAF), que tem na sua dependência a Divisão Financeira e Controlo de Gestão (DFCG);
A Direção de Serviços de Comunicação e Relações Públicas (DSCRP), que tem a coordenação funcional do Secretário-Geral Adjunto;
A Unidade Ministerial de Compras (UMC);
Um Secretário-Geral Adjunto, que por sua vez supervisiona:
A Direção de Serviços de Gestão e Inovação (DSGI), que tem na sua dependência a Divisão de Auditoria (DA);
A Direção de Serviços dos Sistemas de Informação (DSSI);
A Direção de Serviços do Centro de Dados da Defesa (DSCDD).
