A data da criação da Biblioteca do Exército é estabelecida com base na publicação do Decreto de 16 de dezembro de 1836, documento legislativo que determina a criação de uma biblioteca na estrutura orgânica do Exército, à época designada por Biblioteca do Ministério da Guerra.
Em 1929, fundiu-se com a Biblioteca do Corpo de Estado-Maior, criada por Decreto de 30 de outubro de 1884, que alterou a sua designação para Biblioteca do Estado Maior, em 1911. Apesar desta fusão, ambas tiveram percursos paralelos, mantendo as próprias individualidades, comprovadas por coleções, inventários, níveis de descrição bibliográfica diferentes e instalações separadas.
Na dependência da Biblioteca do Exército encontra-se ainda a Biblioteca Digital do Exército, criada em 2014, com o objetivo agregar e disponibilizar conteúdos digitais e digitalizados de diversa tipologia (texto, imagem, som, vídeo, cartografia, iconografia), com origem no vasto património documental constituído por manuscritos, publicações raras, legislação militar, entre outra obras (Despacho nº 34/CEME/2014, de 19 de Fevereiro).
A coleção é constituída por obras em língua portuguesa (a maioria), mas também em latim, francês, inglês, alemão, russo, chinês e árabe, entre outras; dispostos em cerca de 2,4 km de estantes.
A Biblioteca do Exército, partilha o seu vasto património através das seguintes coleções digitais:
- Coleção de Publicações Manuscritas; Coleção de Publicações Antigas;
- Coleção de Legislação Militar; Coleção de Publicações de História Militar;
- Coleção de Publicações de Língua Portuguesa; Coleção de Uniformes, Heráldica e Falerística; Coleção de Imprensa Militar; Coleção Espólio da Engenharia Militar Portuguesa do Século XVIII; Coleção Cartoteca do Centro de Informação Geoespacial do Exército; Coleção de Fotografia; Coleção de Áudio e Coleção de Vídeo.